Народився у Мілані, в сім'ї музикантів. У дитинстві, переїхавши в Рим, вступив до консерваторії, яку закінчив 1929 року. В консерваторські роки, в 1923 році, в Мілані була поставлена його перша ораторія — «L'infanzia di San Giovanni Battista».
З 1930 по 1932 роки Рота жив у США, отримав вчений ступінь у Кертисовському інституті, де він навчався композиції у Розаріо Скалеро і Фріца Рейнера. Після повернення до Італії вивчав літературу в Міланському університеті; пізніше, в 1937 році, почав викладацьку кар'єру. Починаючи з 1950 року і до своєї смерті в 1979 році займав пост директора консерваторії Барі. Помер композитор у Римі.