Джонатан Прайс народився в містечку Холлівелл на півночі Уельсу. Мати — Маргарет Еллен (народжена Вільямс), батько — Ісаак Прайс, колишній шахтар, що керував невеликою продуктовою крамницею зі своєю дружиною. У нього є дві старші сестри В 20 років вступив до одного з найпрестижніших у Великій Британії драматичних навчальних закладів — лондонську Королівську академію драматичного мистецтва (RADA).
Пропрацювавши декілька років в Ліверпулі в якості актора і режисера, Прайс приєднався до Ноттінгемського драматичного театру, в якому грав в спектаклях «Приборкання норовливої» (1973 рік), «Три сестри» (1973), «Кавказьке крейдяне коло» (1974) та інших.
У 1976 році відбувся його бродвейський дебют у виставі «Комедіанти», що приніс йому першу премію «Тоні».
З 1979 року Джонатан Прайс починає працювати в «Королівській шекспірівській трупі» (RSC), якою на той час керував Тревор Нанн. У складі RSC Прайс виконав ролі Петруччіо («Приборкування норовливої»), Октавія («Антоній і Клеопатра»), Анжело («Міра за міру»). У 1980 році актор отримав премію Лоуренса Олів'є за виконання ролі Гамлета — його навіть оголосили одним з кращих Гамлетів його покоління, а в 1986 він зіграв головну роль у трагедії «Макбет». Крім Шекспіра, був ще і Чехів — Астров («Дядя Ваня») і Тригорін («Чайка»).
Згодом грав з такими акторами, як Аль Пачіно, Роберт Де Ніро.
У 2015 зіграф Горобця у Грі Престолів.
