Енді Серкіс народився 20 квітня 1964 року в Райсліп-Мінор, Міддлсекс, Англія. Батько Климент Серкіс — гінеколог вірменського походження, що народився в Іраку. Справжнє прізвище його предків по батьку було Саркісян. Мати Лейла Віч — вчителька англійської мови, англійка за походженням.
Серкіс закінчив Школу Святого Бенедикта у Ілінґу, навчався живопису в Ланкастерському університеті, який закінчив у 1985 році.