Стен Лі народився в Нью-Йорку, у квартирі на розі 98-ї західної вулиці в кінці західного авеню Мангеттену. Його батьки були єврейськими іммігрантами румунського походження — Селія (уроджена Соломон) і Джек Лібер Батько Стена навчався на закрійника суконь, але працював мало, особливо після великої депресії, тому родина переїхала на Форт-Вашингтон авеню. Стен закінчив середню школу ДеВітта Клінтона в Бронксі, куди до цього переїхала його родина. Стен працював на багатьох роботах: він займався написанням некрологів для служби новин і пресрелізів за Національною програмою туберкульозного центру, доставкою сендвічів в офіси (у тому числі й до Рокфеллерівського центру).
11 листопада 2018 у нього раптово погіршився стан здоров'я. Помер Стен Лі на 96-му році життя у клініці Cedars-Sinai Medical Center 12 листопада 2018 після швидкої госпіталізації цього ж дня.
